De bladeren, vers gehakt, worden gebruikt in visgerechten (oa paling in het groen), soepen, sauzen, omelet maar ook in fruitsalades en bowls.
Bij de inmaak van haring, paling en rag kan er ook wat citroenmelisse toegevoegd worden.
Citroenmelisse vormt tevens de basis van vele likeuren zoals “Chartreuse” en “ Eau de Carmes”. Een aftreksel van citroenmelisse geeft een overheerlijke thee.